共聚焦顯微鏡是基于傳統顯微鏡進行研發的衍生產品，其告別傳統顯微鏡進行成像時深度分辨率較差，而使用共聚焦顯微鏡可以對樣品某一層進行成像，具有較高的深度分辨率，進而可以對樣本進行三維成像。下面我們就其原理、功能、應用進行詳細介紹。

在1957年，Marvin Minsky就提出此初期原理，使得不斷研發后，共聚焦顯微鏡可以對某一區域的生物組織樣本進行圖像顯示，并通過不斷調節Z軸深度，對一定Z軸深度范圍內的生物組織進行成像，并通過疊加各個深度的二位成像，得到該區域生物組織的三維圖像重構圖。

共聚焦激光掃描顯微鏡在原理上主要通過引入小孔，使得顯微鏡具有深度分辨率，成像質量增加。并且通過對體樣本進行斷層步進成像，通過后期圖像處理可以得到體樣本三維立體成像。因此從細胞生物學和遺傳學到微生物學和發育生物學，CLSM廣泛用于眾多生物科學學科。它也用于量子光學、納米晶體成像和光譜學都有使用。

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